Кыргызская Государственная консерватория создана Указом Президента Кыргызской Республики от 23 июля 1993 года. В 1998 году Консерватория получила статус Национальной. В КНК функционируют четыре факультета и 14 кафедр, на которых готовятся пианисты, вокалисты, исполнители на кыргызских народных и симфонических инструментах, артисты музыкальной эстрады, дирижеры хора и оркестра, композиторы, музыковеды, балетмейстеры. В 2000 году создан Южный филиал КНК в г. Жалал-Абад, который через три года был перенесен в г. Ош.

В соответствии с Постановлением Правительства Кыргызской Республики КНК является головным учебным заведением, в образовательную систему которого входят средние специальные музыкальные учебные заведения: Кыргызское государственное музыкальное училище имени М. Куренкеева, Каракольское музыкальное училище имени Ы. Туманова, Ошское музыкальное училище имени Ниязаалы, Республиканская средняя специальная музыкальная школа-интернат имени М. Абдраева.

Инициатор создания и ректор КНК – известный композитор, народный артист КР, лауреат Государственной премии им. Токтогула, профессор М. Бегалиев. В консерватории преподают авторитетные музыканты, народные артисты СССР, народные и заслуженные артисты Кыргызской Республики: Токтоналы Сейталиев, Кайыргуль Сартбаева, Улукмырза Полотов, Талгарбек Жакшылыков, Полина Цокуренко, Лариса Георгиева, Зайтуна Нарынбаева, Зенона Слензак-Бегалиева, Камчыбек Дюшалиев, Екатерина Лузанова, Чоробек Шалтакбаев, Калыбек Жекшенов и многие другие.

Кыргызская Национальная консерватория является мощной школой подготовки кадров высшей квалификации, единственным музыкальным вузом в республике с большим творческим потенциалом. За 18 лет КНК подготовила свыше 1000 кадров высшей квалификации. Около 200 студентов и аспирантов завоевали звание лауреатов международных конкурсов, около сотни студентов КНК являются стипендиатами Президентской программы «Прелюдия» и «Алтын-Шаты».

В КНК разработана прогрессивная система музыкальной методики, сочетающая основы отечественной народной педагогики и мировые традиции академического образования. Вуз готовит кадры высшей квалификации для концертных, музыкально-театральных и образовательных учреждений Кыргызстана. Выпускники КНК работают во всех музыкальных коллективах, в музыкальных учебных заведениях, в Кыргызском Национальном академическом театре оперы и балета имени А. Малдыбаева, в Кыргызской Национальной филармонии имени Токтогула, в Национальной телерадиокомпании КР, в других средствах массовой информации, а также за рубежом.

На базе консерватории созданы Большой симфонический оркестр, Оркестр народных инструментов и Духовой оркестр Мэрии г. Бишкек. В КНК действуют следующие творческие коллективы: ансамбль скрипачей и виолончелистов, ансамбль комузистов «Акак», хор, джазовая группа «Sault Peanuts», эстрадная группа и т. д. Таким образом, образовательная политика Кыргызской Национальной консерватории отвечает актуальным вызовам художественной практики XXI в.