Сегодня в академии функционируют педагогический и  национальной виды спорта, тренерский  факультеты, факультет допризывной подготовки и физической культуры, факультет повышения квалификации и переподготовки кадров, заочное отделение, аспирантура, магистратура, научно-учебный центр, библиотека. КГАФКиС располагает современной учебно-¬научной и спортивной базами: футбольно-¬легкоатлетический манеж, гимнастический зал, залы тяжелой атлетики, борьбы, бокса, спортивных игр, таэквондо, стадион, плавательный бассейн. В 30 километрах от г. Бишкек имеется лыжная и туристическая база «Спорт». Одним из основных направлений деятельности академии, является медицинский цикл дисциплин и научный исследований. Общий контингент студентов составляет около 1650 студентов. Обучение студентов осуществляется с отрывом и без отрыва от производства на бюджетной и контрактной основах. К своему 60 — летию Кыргызская государственная академия физической культуры и спорта подошла с заметными успехами и достижениями Можно отметить, что суверенный Кыргызстан имеет вполне опытный коллектив высшего учебного заведения, способный решать вопросы подготовки кадров с высшим физкультурным образованием и спортсменов высокой квалификации.