Кыргызский государственный университет строительства, транспорта и архитектуры имени Н. Исанова был создан 4 мая 1992 года на базе Кыргызского архитектурно - строительного института.

Указом Президента Кыргызской Республики от 17 октября 2008 года университету присвоено имя первого премьер-министра суверенного Кыргызстана — Насирдина Исанова.

КГУСТА реализует все три уровня образования Болонской системы по выпуску бакалавров, магистрантов и PhD-докторов философии, продолжает традиционную подготовку специалистов и научно-педагогических кадров высшей категории. Он имеет диссертационные советы по защите докторских и кандидатских диссертаций по 12 актуальным научным направлениям.

По системе оценки качества высшего профессионального образования «Еврорейтинг-2014» КГУСТА достиг уровня «В+» и входит в число 200 лучших университетов и среди вузов Кыргызстана занимает почетное второе место. Многолетние успехи университета оценены и на национальном уровне: в 2015 г. КГУСТА присуждена премия по качеству «Сапат» Правительства КР, которая присуждается двум лучшим университетам раз в три года; он удостоен также статуса «Лучшее учреждение 2015 г.» Кыргызской Республики.